|
🐜
|
Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities
65 auth.
A. C. D. Silva,
J. Ferro,
F. Reinach,
C. Farah,
L. R. Furlan,
R. B. Quaggio,
C. B. Monteiro-Vitorello,
M. Sluys,
N. Almeida,
L. M. Alves,
A. M. Amaral,
M. Bertolini,
L. Camargo,
G. Camarotte,
F. Cannavan,
...
J. Cardozo,
F. Chambergo,
L. Ciapina,
R. Cicarelli,
L. Coutinho,
J. R. Cursino-Santos,
H. El-Dorry,
J. B. Faria,
A. Ferreira,
R. Ferreira,
M. Ferro,
E. F. Formighieri,
M. Franco,
C. Greggio,
A. Gruber,
A. Katsuyama,
L. T. Kishi,
R. Leite,
E. G. M. Lemos,
M. Lemos,
E. C. Locali,
M. A. Machado,
A. Madeira,
N. Martinez-Rossi,
E. C. Martins,
J. Meidanis,
C. Menck,
C. Miyaki,
D. H. Moon,
L. M. Moreira,
M. T. Novo,
V. Okura,
M. C. Oliveira,
V. R. Oliveira,
H. Pereira,
A. Rossi,
J. Sena,
C. Silva,
R. F. D. Souza,
L. Spinola,
M. Takita,
R. E. Tamura,
E. C. Teixeira,
R. I. Tezza,
M. D. Santos,
D. Truffi,
S. Tsai,
F. White,
J. Setubal,
J. Kitajima
|
10 |
2002 |
10
🐜
|
|
🐜
|
The genome of woodland strawberry (Fragaria vesca)
71 auth.
V. Shulaev,
D. Sargent,
R. Crowhurst,
T. Mockler,
O. Folkerts,
A. Delcher,
P. Jaiswal,
K. Mockaitis,
A. Liston,
S. Mane,
P. Burns,
T. Davis,
J. Slovin,
N. Bassil,
R. Hellens,
...
C. Evans,
T. Harkins,
C. Kodira,
B. Desany,
O. Crasta,
R. Jensen,
A. Allan,
T. Michael,
J. Setubal,
J. Celton,
D. Rees,
K. Williams,
S. H. Holt,
J. J. R. Rojas,
Mithu Chatterjee,
Bo Liu,
H. Silva,
L. Meisel,
A. Adato,
S. Filichkin,
M. Troggio,
R. Viola,
T. Ashman,
Hao Wang,
Palitha Dharmawardhana,
J. Elser,
R. Raja,
Henry D. Priest,
Doug Bryant,
Samuel E. Fox,
S. Givan,
L. Wilhelm,
Sushma Naithani,
A. Christoffels,
David Salama,
Jade Carter,
Elena López Girona,
Anna Zdepski,
Wenqin Wang,
R. Kerstetter,
W. Schwab,
S. Korban,
J. Davik,
A. Monfort,
B. Denoyes-Rothan,
P. Arús,
R. Mittler,
B. Flinn,
A. Aharoni,
J. Bennetzen,
S. Salzberg,
A. Dickerman,
R. Velasco,
M. Borodovsky,
R. Veilleux,
K. Folta
|
10 |
2011 |
10
🐜
|
|
🐢
|
The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa
116 auth.
A. Simpson,
F. Reinach,
P. Arruda,
F. Abreu,
M. Acencio,
R. Alvarenga,
L. M. Alves,
J. Araya,
G. Baía,
C. Baptista,
M. H. Barros,
E. D. Bonaccorsi,
S. Bordin,
J. Bové,
M. Briones,
...
M. R. Bueno,
A. Camargo,
L. Camargo,
D. Carraro,
H. Carrer,
N. Colauto,
C. Colombo,
F. Costa,
M. Costa,
C. Costa-Neto,
L. Coutinho,
M. Cristofani,
E. Dias-Neto,
C. Docena,
H. El-Dorry,
A. P. Facincani,
A. Ferreira,
V. C. Ferreira,
J. Ferro,
J. Fraga,
S. C. França,
M. Franco,
M. Frohme,
L. R. Furlan,
M. Garnier,
G. Goldman,
M. Goldman,
S. Gomes,
A. Gruber,
P. Ho,
J. Hoheisel,
M. L. Junqueira,
E. Kemper,
J. Kitajima,
J. Krieger,
E. Kuramae,
F. Laigret,
M. Lambais,
L. C. Leite,
E. G. Lemos,
M. Lemos,
S. Lopes,
C. R. Lopes,
J. A. Machado,
M. A. Machado,
A. Madeira,
H. Madeira,
C. Marino,
M. Marques,
E. A. Martins,
E. Martins,
A. Y. Matsukuma,
C. Menck,
E. Miracca,
C. Miyaki,
C. B. Monteiro-Vitorello,
D. H. Moon,
M. Nagai,
A. L. Nascimento,
L. Netto,
A. Nhani,
F. Nóbrega,
L. R. Nunes,
M. A. Oliveira,
M. C. D. Oliveira,
R. C. D. Oliveira,
D. A. Palmieri,
A. Paris,
B. R. Peixoto,
G. G. Pereira,
H. Pereira,
J. Pesquero,
R. B. Quaggio,
P. G. Roberto,
V. Rodrigues,
A. J. D. M. Rosa,
V. E. Rosa,
R. Sá,
R. Santelli,
H. Sawasaki,
A. C. D. Silva,
A. C. D. Silva,
Felipe Rodrigues da Silva,
W. A. Silva,
J. Silveira,
M. Silvestri,
W. Siqueira,
A. A. Souza,
A. P. Souza,
M. F. Terenzi,
D. Truffi,
S. Tsai,
M. H. Tsuhako,
H. Vallada,
M. Sluys,
S. Verjovski-Almeida,
A. Vettore,
M. Zago,
M. Zatz,
J. Meidanis,
J. Setubal
|
9 |
2000 |
9
🐢
|
|
🐜
|
The Genome of the Natural Genetic Engineer Agrobacterium tumefaciens C58
51 auth.
D. Wood,
J. Setubal,
R. Kaul,
D. E. Monks,
J. Kitajima,
V. Okura,
Yang Zhou,
Li-shan Chen,
G. Wood,
N. Almeida,
Lisa Woo,
YuChing Chen,
I. Paulsen,
J. Eisen,
P. Karp,
...
Donald Bovee,
P. Chapman,
J. Clendenning,
G. Deatherage,
Will Gillet,
Charles Grant,
Tatyana Kutyavin,
R. Levy,
Menglu Li,
Erin McClelland,
A. Palmieri,
Christopher Raymond,
G. Rouse,
C. Saenphimmachak,
Zaining Wu,
P. Romero,
David S. Gordon,
Shiping Zhang,
Heayun Yoo,
Yumin Tao,
P. Biddle,
M. Jung,
William Krespan,
Michael Perry,
Bill Gordon-Kamm,
L. Liao,
Sun Kim,
C. Hendrick,
Zuo-yu Zhao,
M. Dolan,
F. Chumley,
S. Tingey,
J. Tomb,
M. Gordon,
M. Olson,
E. Nester
|
9 |
2001 |
9
🐜
|
|
🦁
|
Introduction to computational molecular biology
J. Setubal,
J. Meidanis
|
9 |
1997 |
9
🦁
|
|
🐜
|
Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation
39 auth.
A. M. Thomas,
P. Manghi,
F. Asnicar,
Edoardo Pasolli,
F. Armanini,
Moreno Zolfo,
F. Beghini,
S. Manara,
Nicolai Karcher,
C. Pozzi,
S. Gandini,
D. Serrano,
S. Tarallo,
A. Francavilla,
G. Gallo,
...
M. Trompetto,
G. Ferrero,
Sayaka Mizutani,
H. Shiroma,
Satoshi Shiba,
T. Shibata,
S. Yachida,
Takuji Yamada,
J. Wirbel,
P. Schrotz-King,
C. Ulrich,
H. Brenner,
Manimozhiyan Arumugam,
P. Bork,
G. Zeller,
F. Cordero,
E. Dias-Neto,
J. Setubal,
Adrian Tett,
B. Pardini,
M. Rescigno,
L. Waldron,
A. Naccarati,
N. Segata
|
9 |
2019 |
9
🐜
|
|
🐜
|
A genomic catalog of Earth’s microbiomes
267 auth.
Stephen Nayfach,
S. Roux,
Rekha Seshadri,
Daniel W. Udwary,
N. Varghese,
Frederik Schulz,
Dongying Wu,
David Páez-Espino,
I. Chen,
Marcel Huntemann,
Krishna Palaniappan,
J. Ladau,
Supratim Mukherjee,
T. Reddy,
T. Nielsen,
...
Edward Kirton,
José P. Faria,
Janaka N. Edirisinghe,
C. Henry,
S. Jungbluth,
D. Chivian,
Paramvir S. Dehal,
E. Wood-Charlson,
A. Arkin,
S. Tringe,
A. Visel,
H. Abreu,
S. Acinas,
E. Allen,
M. Allen,
L. Alteio,
G. Andersen,
A. Anesio,
G. Attwood,
Viridiana Avila-Magaña,
Yacine Badis,
J. Bailey,
B. Baker,
P. Baldrian,
H. Barton,
D. Beck,
Eric D. Becraft,
H. Beller,
J. Beman,
R. Bernier-Latmani,
T. Berry,
Anthony D. Bertagnolli,
S. Bertilsson,
Jennifer M. Bhatnagar,
J. Bird,
Jeffrey L. Blanchard,
Sara E. Blumer-Schuette,
B. Bohannan,
M. Borton,
Allyson Brady,
S. Brawley,
J. Brodie,
Steven Brown,
Jennifer R. Brum,
A. Brune,
D. Bryant,
A. Buchan,
D. Buckley,
J. Buongiorno,
H. Cadillo-Quiroz,
S. Caffrey,
A. Campbell,
Barbara Campbell,
S. Carr,
J. Carroll,
S. Cary,
Anna M. Cates,
R. Cattolico,
R. Cavicchioli,
L. Chistoserdova,
Maureen L. Coleman,
P. Constant,
Jonathan M. Conway,
W. M. Mac Cormack,
S. Crowe,
B. Crump,
C. Currie,
R. Daly,
Kristen M. DeAngelis,
Vincent J. Denef,
S. Denman,
A. Desta,
H. Dionisi,
J. Dodsworth,
Nina Dombrowski,
Timothy Donohue,
Mark Dopson,
Timothy P. Driscoll,
P. Dunfield,
C. Dupont,
Katherine A. Dynarski,
V. Edgcomb,
E. Edwards,
M. Elshahed,
Israel Figueroa,
Beverly E. Flood,
Nathaniel W. Fortney,
Caroline S. Fortunato,
C. Francis,
C. Gachon,
S. Garcia,
M. C. Gazitúa,
T. Gentry,
L. Gerwick,
Javad Gharechahi,
P. Girguis,
J. Gladden,
M. Gradoville,
S. Grasby,
Kelly Gravuer,
C. Grettenberger,
R. Gruninger,
Jiarong Guo,
M. Habteselassie,
S. Hallam,
R. Hatzenpichler,
B. Hausmann,
T. Hazen,
B. Hedlund,
C. Henny,
L. Herfort,
Maria Hernandez,
Olivia S. Hershey,
M. Hess,
E. Hollister,
L. Hug,
D. Hunt,
J. Jansson,
J. Jarett,
V. Kadnikov,
C. Kelly,
R. Kelly,
W. Kelly,
C. Kerfeld,
Jefferey A Kimbrel,
J. Klassen,
K. Konstantinidis,
Laura L. Lee,
Wenjun Li,
Andrew J. Loder,
A. Loy,
M. Lozada,
B. MacGregor,
C. Magnabosco,
Aline Maria da Silva,
R. McKay,
K. McMahon,
C. McSweeney,
Mónica Medina,
Laura K. Meredith,
Jessica E. Mizzi,
T. Mock,
L. Momper,
M. Moran,
C. Morgan-Lang,
D. Moser,
G. Muyzer,
D. Myrold,
Maisie Nash,
C. Nesbø,
A. Neumann,
R. Neumann,
D. Noguera,
T. Northen,
J. Norton,
Brent Nowinski,
K. Nüsslein,
M. O’Malley,
R. Oliveira,
Valéria Maia de Oliveira,
T. Onstott,
J. Osvatic,
Ouyang Yang,
M. Pachiadaki,
J. Parnell,
L. Partida-Martínez,
K. Peay,
D. Pelletier,
Xuefeng Peng,
Michael Pester,
J. Pett‐Ridge,
Sari Peura,
P. Pjevac,
Alvaro M. Plominsky,
Anja Poehlein,
P. Pope,
N. Ravin,
M. Redmond,
Rebecca A. Reiss,
V. Rich,
Christian Rinke,
J. L. M. Rodrigues,
W. Rodríguez-Reillo,
K. Rossmassler,
Joshua D. Sackett,
G. Salekdeh,
Scott Saleska,
M. Scarborough,
D. Schachtman,
C. Schadt,
M. Schrenk,
A. Sczyrba,
A. Sengupta,
J. Setubal,
A. Shade,
Christine Sharp,
D. Sherman,
O. Shubenkova,
I. N. Sierra-Garcia,
R. Simister,
H. Simon,
S. Sjöling,
J. Slonczewski,
Rafael Soares Correa de Souza,
J. Spear,
J. Stegen,
R. Stepanauskas,
F. Stewart,
G. Suen,
Matthew B. Sullivan,
D. Sumner,
B. Swan,
W. Swingley,
J. Tarn,
G. Taylor,
H. Teeling,
M. Tekere,
A. Teske,
T. Thomas,
C. Thrash,
J. Tiedje,
C. Ting,
B. Tully,
G. Tyson,
Osvlado Ulloa,
D. Valentine,
Marc Warwick Van Goethem,
J. VanderGheynst,
T. Verbeke,
John Vollmers,
A. Vuillemin,
N. Waldo,
D. Walsh,
B. Weimer,
T. Whitman,
P. van der Wielen,
Michael Wilkins,
Timothy J. Williams,
B. Woodcroft,
Jamie Woolet,
K. Wrighton,
Jun Ye,
E. Young,
N. Youssef,
F. Yu,
T. Zemskaya,
Ryan M. Ziels,
T. Woyke,
N. Mouncey,
Natalia N. Ivanova,
N. Kyrpides,
E. Eloe-Fadrosh
|
9 |
2020 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni
37 auth.
S. Verjovski-Almeida,
R. DeMarco,
E. A. Martins,
P. E. Guimarães,
E. P. Ojopi,
A. Paquola,
João Piazza,
M. Nishiyama,
J. Kitajima,
R. Adamson,
P. Ashton,
M. F. Bonaldo,
P. Coulson,
G. P. Dillon,
L. P. Farias,
...
S. P. Gregório,
P. Ho,
Ricardo A. Leite,
L. C. Malaquias,
R. C. P. Marques,
P. Miyasato,
A. L. Nascimento,
F. P. Ohlweiler,
E. M. Reis,
M. A. Ribeiro,
R. G. Sá,
Gaëlle C Stukart,
M. Soares,
Cybele Gargioni,
T. Kawano,
V. Rodrigues,
A. Madeira,
R. Wilson,
C. Menck,
J. Setubal,
L. Leite,
E. Dias-Neto
|
8 |
2003 |
8
🐜
|
|
🐢
|
Protein secretion systems in bacterial-host associations, and their description in the Gene Ontology
T. Tseng,
B. Tyler,
J. Setubal
|
8 |
2009 |
8
🐢
|
|
🐜
|
Comparative Genomics of Two Leptospira interrogans Serovars Reveals Novel Insights into Physiology and Pathogenesis
48 auth.
A. L. Nascimento,
A. Ko,
A. Ko,
E. A. Martins,
C. B. Monteiro-Vitorello,
P. Ho,
D. Haake,
S. Verjovski-Almeida,
R. Hartskeerl,
M. Marques,
M. C. Oliveira,
C. Menck,
L. Leite,
H. Carrer,
L. Coutinho,
...
W. Degrave,
O. Dellagostin,
H. El-Dorry,
E. Ferro,
M. Ferro,
L. R. Furlan,
M. Gamberini,
É. Giglioti,
A. Góes-Neto,
G. Goldman,
M. Goldman,
R. Harakava,
S. Jerônimo,
I. Junqueira-de-Azevedo,
E. Kimura,
E. Kuramae,
E. G. Lemos,
M. Lemos,
C. Marino,
L. R. Nunes,
R. C. Oliveira,
G. Pereira,
M. Reis,
A. Schriefer,
W. Siqueira,
P. Sommer,
S. Tsai,
A. Simpson,
J. Ferro,
L. Camargo,
J. Kitajima,
J. Setubal,
M. Sluys
|
8 |
2004 |
8
🐜
|
|
🐬
|
Distribution of nitrogen fixation and nitrogenase-like sequences amongst microbial genomes
P. D. Dos Santos,
Z. Fang,
Steven W Mason,
J. Setubal,
R. Dixon
|
8 |
2012 |
8
🐬
|
|
🐜
|
Comparative Analyses of the Complete Genome Sequences of Pierce's Disease and Citrus Variegated Chlorosis Strains of Xylella fastidiosa
58 auth.
M. van Sluys,
M. C. de Oliveira,
C. B. Monteiro-Vitorello,
C. Miyaki,
L. R. Furlan,
L. Camargo,
A. D. da Silva,
D. H. Moon,
M. Takita,
E. G. Lemos,
M. A. Machado,
M. Ferro,
Felipe Rodrigues da Silva,
M. Goldman,
G. Goldman,
...
M. Lemos,
H. El-Dorry,
S. Tsai,
H. Carrer,
D. Carraro,
R. C. de Oliveira,
L. R. Nunes,
W. Siqueira,
L. Coutinho,
E. Kimura,
E. S. Ferro,
R. Harakava,
E. Kuramae,
C. Marino,
É. Giglioti,
I. L. Abreu,
L. M. Alves,
A. M. do Amaral,
G. Baía,
S. Blanco,
M. S. Brito,
F. Cannavan,
A. Celestino,
A. F. da Cunha,
R. C. Fenille,
J. Ferro,
E. F. Formighieri,
L. T. Kishi,
S. G. Leoni,
A. R. Oliveira,
V. E. Rosa,
F. T. Sassaki,
J. Sena,
A. D. de Souza,
D. Truffi,
F. Tsukumo,
G. M. Yanai,
L. G. Zaros,
E. Civerolo,
A. Simpson,
N. Almeida,
J. Setubal,
J. Kitajima
|
8 |
2003 |
8
🐜
|
|
🐜
|
Butyrate Protects Mice from Clostridium difficile-Induced Colitis through an HIF-1-Dependent Mechanism.
23 auth.
J. Fachi,
J. S. Felipe,
L. P. Pral,
B. K. da Silva,
R. Corrêa,
Mirella Cristiny Pereira de Andrade,
D. M. da Fonseca,
P. Basso,
N. Câmara,
É. L. de Sales E Souza,
...
F. dos Santos Martins,
S. Guima,
A. M. Thomas,
J. Setubal,
Yuli Thamires Magalhães,
F. Forti,
Thamiris Candreva,
H. Rodrigues,
M. D. de Jesus,
S. Consonni,
A. Farias,
P. Varga-Weisz,
M. Vinolo
|
7 |
2019 |
7
🐜
|
