|
🐜
|
Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers
41 auth.
E. Chatelier,
T. Nielsen,
J. Qin,
Edi Prifti,
F. Hildebrand,
G. Falony,
Mathieu Almeida,
Manimozhiyan Arumugam,
Jean-Michel Batto,
S. Kennedy,
Pierre Leonard,
Junhua Li,
K. Burgdorf,
N. Grarup,
T. Jørgensen,
...
I. Brandslund,
H. Nielsen,
A. S. Juncker,
Marcelo Bertalan,
F. Levenez,
N. Pons,
Simon Rasmussen,
S. Sunagawa,
J. Tap,
S. Tims,
E. Zoetendal,
S. Brunak,
K. Clément,
J. Doré,
M. Kleerebezem,
K. Kristiansen,
P. Renault,
Thomas Sicheritz-Pontén,
W. M. Vos,
Jean-Daniel Zucker,
J. Raes,
T. Hansen,
P. Bork,
Jun Wang,
S. Ehrlich,
O. Pedersen
|
11 |
2013 |
11
🐜
|
|
🦁
|
Structure and function of the global ocean microbiome
50 auth.
S. Sunagawa,
Luis Pedro Coelho,
Samuel Chaffron,
Jens Roat Kultima,
K. Labadie,
Guillem Salazar,
Bardya Djahanschiri,
G. Zeller,
D. Mende,
A. Alberti,
Francisco M. Cornejo-Castillo,
P. Costea,
C. Cruaud,
F. d’Ovidio,
S. Engelen,
...
I. Ferrera,
J. Gasol,
L. Guidi,
F. Hildebrand,
F. Kokoszka,
C. Lepoivre,
G. Lima-Mendez,
J. Poulain,
B. Poulos,
M. Royo-Llonch,
H. Sarmento,
S. Vieira-Silva,
C. Dimier,
M. Picheral,
S. Searson,
S. Kandels-Lewis,
C. Bowler,
C. Vargas,
G. Gorsky,
N. Grimsley,
P. Hingamp,
D. Iudicone,
O. Jaillon,
F. Not,
H. Ogata,
S. Pesant,
S. Speich,
L. Stemmann,
M. Sullivan,
J. Weissenbach,
P. Wincker,
E. Karsenti,
J. Raes,
S. Acinas,
P. Bork
|
11 |
2015 |
11
🦁
|
|
🐜
|
eggNOG 4.5: a hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic and viral sequences
13 auth.
J. Huerta-Cepas,
Damian Szklarczyk,
K. Forslund,
H. Cook,
Davide Heller,
M. Walter,
T. Rattei,
D. Mende,
S. Sunagawa,
Michael Kuhn,
...
L. Jensen,
C. V. Mering,
P. Bork
|
10 |
2015 |
10
🐜
|
|
🐜
|
An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome
87 auth.
Junhua Li,
Huijue Jia,
Xianghang Cai,
Huanzi Zhong,
Q. Feng,
S. Sunagawa,
Manimozhiyan Arumugam,
Jens Roat Kultima,
Edi Prifti,
T. Nielsen,
A. S. Juncker,
C. Manichanh,
Bing Chen,
Wenwei Zhang,
F. Levenez,
...
Juan Wang,
Xun Xu,
L. Xiao,
Suisha Liang,
Dongya Zhang,
Zhaoxi Zhang,
Weineng Chen,
Hailong Zhao,
J. Al-Aama,
Sherif Edris,
Huanming Yang,
Jian Wang,
T. Hansen,
H. Nielsen,
S. Brunak,
K. Kristiansen,
F. Guarner,
O. Pedersen,
J. Doré,
S. Ehrlich,
N. Pons,
E. Le Chatelier,
Jean-Michel Batto,
S. Kennedy,
Florence Haimet,
Yohanan Winogradski,
É. Pelletier,
D. Lepaslier,
F. Artiguenave,
T. Bruls,
Jean Weissenbach,
K. Turner,
J. Parkhill,
M. Antolín,
F. Casellas,
N. Borruel,
E. Varela,
A. Torrejon,
G. Denariaz,
M. Derrien,
J. V. H. van Hylckama Vlieg,
P. Viega,
R. Oozeer,
J. Knoll,
M. Rescigno,
C. Bréchot,
C. M'rini,
Alexandre Mérieux,
Takuji Yamada,
S. Tims,
E. Zoetendal,
M. Kleerebezem,
W. D. de Vos,
Antonella Cultrone,
M. Leclerc,
C. Juste,
É. Guédon,
C. Delorme,
Séverine Layec,
Ghalia Khaci,
M. van de Guchte,
Gaetana Vandemeulebrouck,
A. Jamet,
R. Dervyn,
Nicolas Sanchez,
H. Blottière,
E. Maguin,
P. Renault,
J. Tap,
D. Mende,
P. Bork,
Jun Wang
|
10 |
2014 |
10
🐜
|
|
🐜
|
Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity
34 auth.
H. Pedersen,
Valborg Gudmundsdottir,
H. Nielsen,
Tuulia Hyotylainen,
T. Nielsen,
B. Jensen,
K. Forslund,
F. Hildebrand,
Edi Prifti,
G. Falony,
E. Chatelier,
F. Levenez,
J. Doré,
I. Mattila,
D. Plichta,
...
Päivi Pöhö,
L. Hellgren,
Manimozhiyan Arumugam,
S. Sunagawa,
S. Vieira-Silva,
T. Jørgensen,
J. Holm,
K. Trošt,
MetaHIT consortium,
K. Kristiansen,
S. Brix,
J. Raes,
Jun Wang,
T. Hansen,
P. Bork,
S. Brunak,
M. Orešič,
S. Ehrlich,
O. Pedersen
|
10 |
2016 |
10
🐜
|
|
🐜
|
Eukaryotic plankton diversity in the sunlit ocean
54 auth.
C. de Vargas,
S. Audic,
N. Henry,
J. Decelle,
F. Mahé,
R. Logares,
E. Lara,
Cédric Berney,
Noan Le Bescot,
I. Probert,
Margaux Carmichael,
J. Poulain,
S. Romac,
S. Colin,
J. Aury,
...
L. Bittner,
Samuel Chaffron,
Micah Dunthorn,
S. Engelen,
Olga Flegontova,
L. Guidi,
A. Horák,
O. Jaillon,
G. Lima-Mendez,
J. Lukeš,
S. Malviya,
R. Morard,
M. Mulot,
Eleonora Scalco,
R. Siano,
Flora Vincent,
A. Zingone,
C. Dimier,
M. Picheral,
S. Searson,
S. Kandels-Lewis,
S. Acinas,
P. Bork,
C. Bowler,
G. Gorsky,
N. Grimsley,
P. Hingamp,
D. Iudicone,
F. Not,
H. Ogata,
S. Pesant,
J. Raes,
M. Sieracki,
S. Speich,
L. Stemmann,
S. Sunagawa,
J. Weissenbach,
P. Wincker,
E. Karsenti
|
10 |
2015 |
10
🐜
|
|
🐜
|
Structure and function of the global topsoil microbiome
21 auth.
M. Bahram,
F. Hildebrand,
Sofia K. Forslund,
Jennifer L. Anderson,
Nadejda A. Soudzilovskaia,
P. Bodegom,
J. Bengtsson-Palme,
Sten Anslan,
Luis Pedro Coelho,
Helery Harend,
...
J. Huerta-Cepas,
M. Medema,
M. Maltz,
S. Mundra,
P. Olsson,
M. Pent,
Sergei Põlme,
S. Sunagawa,
Martin Ryberg,
L. Tedersoo,
P. Bork
|
10 |
2018 |
10
🐜
|
|
🐜
|
Salt-responsive gut commensal modulates TH17 axis and disease
39 auth.
N. Wilck,
M. Matus,
Sean M. Kearney,
S. Olesen,
K. Forslund,
H. Bartolomaeus,
S. Haase,
A. Mähler,
A. Balogh,
L. Markó,
O. Vvedenskaya,
Friedrich H. Kleiner,
D. Tsvetkov,
Lars Klug,
P. Costea,
...
S. Sunagawa,
Lisa Maier,
N. Rakova,
Valentin Schatz,
Patrick Neubert,
Christian Frätzer,
A. Krannich,
M. Gollasch,
Diana A. Grohme,
Beatriz Côrte-Real,
Roman G. Gerlach,
M. Basic,
Athanasios Typas,
Chuan Wu,
J. Titze,
J. Jantsch,
M. Boschmann,
R. Dechend,
Markus Kleinewietfeld,
S. Kempa,
P. Bork,
R. Linker,
E. Alm,
D. Müller
|
9 |
2017 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes
98 auth.
H. B. Nielsen,
Mathieu Almeida,
A. S. Juncker,
Simon Rasmussen,
Junhua Li,
S. Sunagawa,
D. Plichta,
Laurent Gautier,
Anders G Pedersen,
E. Le Chatelier,
Eric Pelletier,
Ida Bonde,
Trine Nielsen,
C. Manichanh,
Manimozhiyan Arumugam,
...
Jean-Michel Batto,
Marcelo B Quintanilha dos Santos,
Nikolaj S. Blom,
N. Borruel,
K. Burgdorf,
F. Boumezbeur,
Francesc Casellas,
J. Doré,
Piotr Dworzynski,
F. Guarner,
T. Hansen,
F. Hildebrand,
R. Kaas,
Sean Kennedy,
Karsten Kristiansen,
Jens Roat Kultima,
Pierre Leonard,
F. Levenez,
Ole Lund,
Bouziane Moumen,
Denis Le Paslier,
N. Pons,
Oluf Pedersen,
Edi Prifti,
Junjie Qin,
Jeroen Raes,
Søren J Sørensen,
Julien Tap,
S. Tims,
D. Ussery,
Takuji Yamada,
A. S. Juncker,
Manimozhiyan Arumugam,
Karsten Kristiansen,
Pierre Leonard,
P. Renault,
Thomas Sicheritz-Pontén,
Peer Bork,
Jun Wang,
S. Brunak,
S. D. Ehrlich,
A. Jamet,
Alexandre Mérieux,
Antonella Cultrone,
A. Torrejon,
Benoît Quinquis,
Christian Bréchot,
C. Delorme,
Christine M'Rini,
Willem M. de Vos,
Emmanuelle Maguin,
E. Varela,
É. Guédon,
Falony Gwen,
Florence Haimet,
F. Artiguenave,
Gaetana Vandemeulebrouck,
G. Denariaz,
Ghalia Khaci,
H. Blottière,
Jan Knol,
Jean Weissenbach,
J. V. H. van Hylckama Vlieg,
J. Torben,
Julian Parkhill,
K. Turner,
M. van de Guchte,
M. Antolín,
Maria Rescigno,
M. Kleerebezem,
M. Derrien,
N. Galleron,
Nicolas Sanchez,
N. Grarup,
P. Veiga,
R. Oozeer,
R. Dervyn,
Séverine Layec,
T. Bruls,
Yohanan Winogradski,
Zoetendal Erwin G,
S. Brunak,
S. D. Ehrlich
|
9 |
2014 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes
98 auth.
H. B. Nielsen,
Mathieu Almeida,
A. S. Juncker,
Simon Rasmussen,
Junhua Li,
S. Sunagawa,
D. Plichta,
Laurent Gautier,
Anders G Pedersen,
E. Le Chatelier,
Eric Pelletier,
Ida Bonde,
Trine Nielsen,
C. Manichanh,
Manimozhiyan Arumugam,
...
Jean-Michel Batto,
Marcelo B Quintanilha dos Santos,
Nikolaj S. Blom,
N. Borruel,
K. Burgdorf,
F. Boumezbeur,
Francesc Casellas,
J. Doré,
Piotr Dworzynski,
F. Guarner,
T. Hansen,
F. Hildebrand,
R. Kaas,
Sean Kennedy,
Karsten Kristiansen,
Jens Roat Kultima,
Pierre Leonard,
F. Levenez,
Ole Lund,
Bouziane Moumen,
Denis Le Paslier,
N. Pons,
Oluf Pedersen,
Edi Prifti,
Junjie Qin,
Jeroen Raes,
Søren J Sørensen,
Julien Tap,
S. Tims,
D. Ussery,
Takuji Yamada,
A. S. Juncker,
Manimozhiyan Arumugam,
Karsten Kristiansen,
Pierre Leonard,
P. Renault,
Thomas Sicheritz-Pontén,
Peer Bork,
Jun Wang,
S. Brunak,
S. D. Ehrlich,
A. Jamet,
Alexandre Mérieux,
Antonella Cultrone,
A. Torrejon,
Benoît Quinquis,
Christian Bréchot,
C. Delorme,
Christine M'Rini,
Willem M. de Vos,
Emmanuelle Maguin,
E. Varela,
É. Guédon,
Falony Gwen,
Florence Haimet,
F. Artiguenave,
Gaetana Vandemeulebrouck,
G. Denariaz,
Ghalia Khaci,
H. Blottière,
Jan Knol,
Jean Weissenbach,
J. V. H. van Hylckama Vlieg,
J. Torben,
Julian Parkhill,
K. Turner,
M. van de Guchte,
M. Antolín,
Maria Rescigno,
M. Kleerebezem,
M. Derrien,
N. Galleron,
Nicolas Sanchez,
N. Grarup,
P. Veiga,
R. Oozeer,
R. Dervyn,
Séverine Layec,
T. Bruls,
Yohanan Winogradski,
Zoetendal Erwin G,
S. Brunak,
S. D. Ehrlich
|
9 |
2014 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer
35 auth.
J. Wirbel,
P. Pyl,
Ece Kartal,
Konrad Zych,
A. Kashani,
A. Milanese,
J. S. Fleck,
A. Voigt,
A. Pallejà,
R. Ponnudurai,
S. Sunagawa,
Luis Pedro Coelho,
P. Schrotz-King,
E. Vogtmann,
N. Habermann,
...
E. Niméus,
A. M. Thomas,
P. Manghi,
S. Gandini,
D. Serrano,
Sayaka Mizutani,
H. Shiroma,
Satoshi Shiba,
T. Shibata,
S. Yachida,
Takuji Yamada,
L. Waldron,
A. Naccarati,
N. Segata,
R. Sinha,
C. Ulrich,
H. Brenner,
Manimozhiyan Arumugam,
P. Bork,
G. Zeller
|
9 |
2019 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Determinants of community structure in the global plankton interactome
50 auth.
G. Lima-Mendez,
Karoline Faust,
N. Henry,
J. Decelle,
S. Colin,
Fabrizio Carcillo,
Samuel Chaffron,
J. C. Ignacio-Espinosa,
S. Roux,
Flora Vincent,
L. Bittner,
Youssef Darzi,
Jun Wang,
S. Audic,
L. Berline,
...
Gianluca Bontempi,
A. M. Cabello,
L. Coppola,
Francisco M. Cornejo-Castillo,
F. d’Ovidio,
L. De Meester,
I. Ferrera,
Marie-José Garet-Delmas,
L. Guidi,
Elena Lara,
S. Pesant,
M. Royo-Llonch,
Guillem Salazar,
Pablo Sánchez,
M. Sebastián,
Caroline Souffreau,
C. Dimier,
M. Picheral,
S. Searson,
S. Kandels-Lewis,
G. Gorsky,
F. Not,
H. Ogata,
S. Speich,
L. Stemmann,
J. Weissenbach,
P. Wincker,
S. Acinas,
S. Sunagawa,
P. Bork,
M. Sullivan,
E. Karsenti,
C. Bowler,
C. de Vargas,
J. Raes
|
9 |
2015 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Genomic variation landscape of the human gut microbiome
14 auth.
S. Schloissnig,
Manimozhiyan Arumugam,
S. Sunagawa,
M. Mitreva,
J. Tap,
Ana Zhu,
Alison S. Waller,
D. Mende,
Jens Roat Kultima,
John Martin,
...
Karthik Kota,
S. Sunyaev,
G. Weinstock,
P. Bork
|
9 |
2012 |
9
🐜
|
|
🐜
|
Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition
29 auth.
P. Costea,
F. Hildebrand,
Manimozhiyan Arumugam,
F. Bäckhed,
Martin J. Blaser,
F. Bushman,
Willem M. de Vos,
S. Ehrlich,
Claire M. Fraser,
M. Hattori,
C. Huttenhower,
I. Jeffery,
D. Knights,
James D. Lewis,
R. Ley,
...
H. Ochman,
P. W. O’Toole,
C. Quince,
D. Relman,
F. Shanahan,
S. Sunagawa,
Jun Wang,
G. Weinstock,
Gary D. Wu,
G. Zeller,
Liping Zhao,
J. Raes,
R. Knight,
P. Bork
|
9 |
2017 |
9
🐜
|
