|
🐜
|
Structure and function of the global topsoil microbiome
21 auth.
M. Bahram,
F. Hildebrand,
Sofia K. Forslund,
Jennifer L. Anderson,
Nadejda A. Soudzilovskaia,
P. Bodegom,
J. Bengtsson-Palme,
Sten Anslan,
Luis Pedro Coelho,
Helery Harend,
...
J. Huerta-Cepas,
M. Medema,
M. Maltz,
S. Mundra,
P. Olsson,
M. Pent,
Sergei Põlme,
S. Sunagawa,
Martin Ryberg,
L. Tedersoo,
P. Bork
|
10 |
2018 |
10
🐜
|
|
🐜
|
Improved software detection and extraction of ITS1 and ITS2 from ribosomal ITS sequences of fungi and other eukaryotes for analysis of environmental sequencing data
21 auth.
J. Bengtsson-Palme,
Martin Ryberg,
M. Hartmann,
S. Branco,
Z. Wang,
Anna Godhe,
P. Wit,
M. Sánchez-García,
I. Ebersberger,
F. Sousa,
...
A. Amend,
A. Jumpponen,
M. Unterseher,
E. Kristiansson,
K. Abarenkov,
Y. Bertrand,
Kemal Sanli,
K. M. Eriksson,
U. Vik,
Vilmar Veldre,
R. Nilsson
|
9 |
2013 |
9
🐜
|
|
🐬
|
Intraspecific ITS Variability in the Kingdom Fungi as Expressed in the International Sequence Databases and Its Implications for Molecular Species Identification
Henrik R. Nilsson,
R. H. Nilsson,
E. Kristiansson,
Martin Ryberg,
N. Hallenberg,
K. Larsson
|
9 |
2008 |
9
🐬
|
|
🐬
|
Taxonomic Reliability of DNA Sequences in Public Sequence Databases: A Fungal Perspective
R. Nilsson,
Martin Ryberg,
E. Kristiansson,
K. Abarenkov,
K. Larsson,
U. Kõljalg
|
9 |
2006 |
9
🐬
|
|
🐜
|
FungalTraits: a user-friendly traits database of fungi and fungus-like stramenopiles
128 auth.
Sergei Põlme,
K. Abarenkov,
R. Henrik Nilsson,
Björn D. Lindahl,
K. Clemmensen,
H. Kauserud,
Nhu H. Nguyen,
R. Kjøller,
Scott T. Bates,
P. Baldrian,
T. Frøslev,
K. Adojaan,
A. Vizzini,
A. Suija,
D. Pfister,
...
H. Baral,
H. Järv,
H. Madrid,
J. Nordén,
Jiankui Liu,
J. Pawłowska,
K. Põldmaa,
K. Pärtel,
K. Runnel,
K. Hansen,
K. Larsson,
K. Hyde,
M. Sandoval-Denis,
Matthew E. Smith,
M. Toome‐Heller,
N. Wijayawardene,
N. Menolli,
Nicole K. Reynolds,
R. Drenkhan,
S. Maharachchikumbura,
T. B. Gibertoni,
T. Læssøe,
W. Davis,
Y. Tokarev,
A. Corrales,
A. M. Soares,
A. Agan,
A. R. Machado,
Andrés Argüelles-Moyao,
Andrew P Detheridge,
Angelina de Meiras-Ottoni,
A. Verbeken,
A. Dutta,
B. Cui,
C. Pradeep,
C. Marín,
Daniel Stanton,
Daniyal Gohar,
D. Wanasinghe,
Eveli Otsing,
F. Aslani,
G. Griffith,
T. Lumbsch,
H. Grossart,
Hossein Masigol,
I. Timling,
Inga Hiiesalu,
J. Oja,
John Kupagme,
J. Geml,
J. Alvarez-Manjarrez,
K. Ilves,
K. Loit,
K. Adamson,
K. Nara,
Kati Küngas,
Keilor Rojas‐Jimenez,
Krišs Bitenieks,
L. Irinyi,
L. Nagy,
Liina Soonvald,
Li-Wei Zhou,
Lysett Wagner,
M. C. Aime,
M. Öpik,
María Isabel Mujica,
Martin Metsoja,
Martin Ryberg,
Martti Vasar,
M. Murata,
M. Nelsen,
M. Cleary,
Milan C. Samarakoon,
M. Doilom,
M. Bahram,
Niloufar Hagh-Doust,
O. Dulya,
Peter Johnston,
P. Kohout,
Qian Chen,
Q. Tian,
R. Nandi,
R. Amiri,
R. H. Perera,
Renata dos Santos Chikowski,
R. L. Mendes-Alvarenga,
R. Garibay-Orijel,
Robin Gielen,
R. Phookamsak,
R. Jayawardena,
S. Rahimlou,
Samantha C. Karunarathna,
S. Tibpromma,
S. Brown,
Siim‐Kaarel Sepp,
S. Mundra,
Zhuhua Luo,
T. Bose,
Tanel Vahter,
Tarquin Netherway,
Teng Yang,
T. May,
T. Varga,
Wei Li,
V. Coimbra,
Virton Rodrigo Targino de Oliveira,
V. X. de Lima,
V. Mikryukov,
Yongzhong Lu,
Y. Matsuda,
Yumiko Miyamoto,
U. Kõljalg,
L. Tedersoo
|
9 |
2020 |
9
🐜
|
|
🐜
|
High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses
9 auth.
L. Tedersoo,
S. Sánchez-Ramírez,
U. Kõljalg,
M. Bahram,
Markus Döring,
D. Schigel,
...
T. May,
Martin Ryberg,
K. Abarenkov
|
8 |
2018 |
8
🐜
|
|
🐜
|
Towards global patterns in the diversity and community structure of ectomycorrhizal fungi.
14 auth.
L. Tedersoo,
M. Bahram,
M. Toots,
A. Diedhiou,
T. Henkel,
R. Kjøller,
M. H. Morris,
K. Nara,
E. Nouhra,
K. Peay,
...
Sergei Põlme,
Martin Ryberg,
Matthew E. Smith,
U. Kõljalg
|
8 |
2012 |
8
🐜
|
|
🐬
|
The ITS region as a target for characterization of fungal communities using emerging sequencing technologies.
R. H. Nilsson,
Martin Ryberg,
K. Abarenkov,
E. Sjökvist,
E. Kristiansson
|
8 |
2009 |
8
🐬
|
|
🐬
|
Relative importance of coarse and fine woody debris for the diversity of wood-inhabiting fungi in temperate broadleaf forests
B. Nordén,
Martin Ryberg,
F. Götmark,
Bettina Olausson
|
8 |
2004 |
8
🐬
|
|
🐜
|
An open source software package for automated extraction of ITS1 and ITS2 from fungal ITS sequences for use in high-throughput community assays and molecular ecology
10 auth.
R. Nilsson,
Vilmar Veldre,
M. Hartmann,
M. Unterseher,
A. Amend,
J. Bergsten,
...
E. Kristiansson,
Martin Ryberg,
A. Jumpponen,
K. Abarenkov
|
7 |
2010 |
7
🐜
|
|
🐜
|
Preserving accuracy in GenBank
255 auth.
T. Bruns,
M. Blackwell,
I. Edwards,
Andy F. S. Taylor,
T. Horton,
Ning Zhang,
U. Kõljalg,
G. May,
T. Kuyper,
J. Bever,
G. Gilbert,
John W. Taylor,
T. DeSantis,
A. Pringle,
J. Borneman,
...
G. Thorn,
M. Berbee,
G. Mueller,
G. Andersen,
E. Vellinga,
S. Branco,
I. Anderson,
I. Dickie,
P. Avis,
S. Timonen,
R. Kjøller,
D. J. Lodge,
R. Bateman,
A. Purvis,
P. Crous,
C. Hawkes,
T. Barraclough,
A. Burt,
R. Nilsson,
K. Larsson,
I. Alexander,
J. Moncalvo,
J. Bérubé,
J. Spatafora,
H. Lumbsch,
J. E. Blair,
S. Suh,
D. Pfister,
M. Binder,
E. Boehm,
L. Kohn,
Juan L Mata,
P. Dyer,
G. Sung,
B. Dentinger,
E. Simmons,
R. Baird,
T. Volk,
B. Perry,
R. Kerrigan,
Jinx Campbell,
J. Rajesh,
D. Reynolds,
D. Geiser,
R. Humber,
N. Hausmann,
T. Szaro,
J. Stajich,
A. Gathman,
K. Peay,
T. Henkel,
C. Robinson,
P. Pukkila,
N. Nguyen,
C. Villalta,
P. Kennedy,
Sarah E. Bergemann,
M. C. Aime,
F. Kauff,
Andrea Porras‐Alfaro,
C. Gueidan,
A. Beck,
B. Andersen,
S. Marek,
J. Crouch,
J. Kerrigan,
J. Ristaino,
K. Hodge,
G. Kuldau,
G. Samuels,
H. Raja,
H. Voglmayr,
M. Gardes,
D. Janos,
J. Rogers,
P. Cannon,
S. Woolfolk,
H. Kistler,
M. Castellano,
Sandra L. Maldonado-Ramírez,
P. Kirk,
J. Farrar,
T. Osmundson,
R. Currah,
V. Vujanovic,
Weidong Chen,
R. Korf,
Z. Atallah,
K. Harrison,
J. Guarro,
Scott T. Bates,
P. Bonello,
P. Bridge,
W. Schell,
W. Rossi,
J. Stenlid,
J. Frisvad,
R. Miller,
S. Baker,
H. Hallen,
J. Janso,
Andrew W. Wilson,
K. Conway,
L. Egerton-Warburton,
Z. Wang,
D. Eastburn,
W. Ho,
S. Kroken,
M. Stadler,
G. Turgeon,
R. W. Lichtwardt,
E. L. Stewart,
M. Wedin,
De Wei Li,
J. Uchida,
A. Jumpponen,
Ron J. Deckert,
H. Beker,
S. Rogers,
Jianping Xu,
P. Johnston,
R. Shoemaker,
Miao Liu,
G. Marques,
B. Summerell,
Serge Sokolski,
U. Thrane,
P. Widden,
J. Bruhn,
V. Bianchinotti,
D. Tuthill,
T. Baroni,
G. L. Barron,
K. Hosaka,
K. Jewell,
M. Piepenbring,
R. Sullivan,
G. Griffith,
Stuart Bradley,
T. Aoki,
W. Yoder,
Y. Ju,
S. Berch,
M. Trappe,
Weijun Duan,
G. Bonito,
R. A. Taber,
G. Coelho,
G. Bills,
Austen R. D. Ganley,
R. Agerer,
L. Nagy,
B. A. Roy,
T. Læssøe,
N. Hallenberg,
H. Tichy,
J. Stalpers,
E. Langer,
M. Scholler,
Dirk Krueger,
G. Pacioni,
R. Pöder,
T. Pennanen,
M. Capelari,
K. Nakasone,
J. Tewari,
A. Miller,
C. Decock,
S. Huhndorf,
M. Wach,
H. Vishniac,
D. Yohalem,
Matthew E. Smith,
A. Glenn,
M. J. Spiering,
D. Lindner,
C. Schoch,
S. Redhead,
K. Ivors,
S. Jeffers,
J. Geml,
F. Okafor,
F. W. Spiegel,
Damon Dewsbury,
J. Carroll,
Terri M. Porter,
C. Pashley,
S. E. Carpenter,
G. Abad,
K. Voigt,
B. Arenz,
A. Methven,
S. Schechter,
P. Vance,
D. Mahoney,
Seogchan Kang,
J. Rheeder,
J. Mehl,
Matthew D. Greif,
G. N. Ngala,
J. Ammirati,
M. Kawasaki,
Yuan Gwo-Fang,
Tadahiko Matsumoto,
G. Koenig,
D. Luoma,
T. May,
M. Leonardi,
L. Sigler,
D. Taylor,
C. Gibson,
T. Sharpton,
D. Hawksworth,
J. C. Dianese,
S. Trudell,
Barbara C Paulus,
M. Padamsee,
P. Callac,
N. Lima,
M. White,
C. Barreau,
M. Juncai,
B. Buyck,
R. Rabeler,
M. Liles,
D. Estes,
Richard Carter,
J. Herr,
Gregory Chandler,
J. Kerekes,
J. Cruse-Sanders,
R. Márquez,
E. Horak,
Michael S. Fitzsimons,
H. Döring,
Su Yao,
Nicole A. Hynson,
Martin Ryberg,
A. Arnold,
K. Hughes
|
7 |
2008 |
7
🐜
|
|
🐜
|
A Comprehensive, Automatically Updated Fungal ITS Sequence Dataset for Reference-Based Chimera Control in Environmental Sequencing Efforts
17 auth.
R. H. Nilsson,
L. Tedersoo,
Martin Ryberg,
E. Kristiansson,
M. Hartmann,
M. Unterseher,
T. Porter,
J. Bengtsson-Palme,
D. Walker,
F. Sousa,
...
H. Gamper,
E. Larsson,
K. Larsson,
U. Kõljalg,
U. Kõljalg,
Robert C. Edgar,
K. Abarenkov
|
7 |
2015 |
7
🐜
|
