|
🐜
|
Mutational signatures in esophageal adenocarcinoma define etiologically distinct subgroups with therapeutic relevance
89 auth.
M. Secrier,
Xiaodun Li,
Nadeera de Silva,
M. Eldridge,
G. Contino,
J. Bornschein,
S. Macrae,
N. Grehan,
M. O'Donovan,
A. Miremadi,
Tsun-Po Yang,
Lawrence Bower,
Hamza Chettouh,
J. Crawte,
N. Galeano-Dalmau,
...
A. Grabowska,
J. Saunders,
T. Underwood,
N. Waddell,
A. Barbour,
B. Nutzinger,
A. Achilleos,
P. Edwards,
A. Lynch,
S. Tavaré,
R. Fitzgerald,
A. Noorani,
R. Elliott,
J. Weaver,
C. Ross-Innes,
Laura Smith,
Z. Abdullahi,
R. de la Rue,
A. Cluroe,
S. Malhotra,
R. Hardwick,
H. Ford,
Mike L. Smith,
J. Davies,
R. Turkington,
S. Hayes,
Y. Ang,
S. Preston,
S. Oakes,
I. Bagwan,
V. Save,
R. Skipworth,
T. Hupp,
J. R. O'Neill,
O. Tucker,
P. Taniere,
F. Noble,
J. Owsley,
L. Lovat,
R. Haidry,
V. Eneh,
C. Crichton,
Hugh Barr,
N. Shepherd,
O. Old,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
F. Chang,
J. Zylstra,
Grant Sanders,
R. Berrisford,
C. Harden,
David G. Bunting,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
S. Parsons,
I. Soomro,
Philip Kaye,
P. Collier,
L. Igali,
I. Welch,
M. Scott,
S. Sothi,
S. Suortamo,
S. Lishman,
D. Beardsmore,
Hayley E. Francies,
M. Garnett,
J. Pearson,
K. Nones,
A. Patch,
S. Grimmond
|
8 |
2016 |
8
🐜
|
|
🐜
|
Ordering of mutations in preinvasive disease stages of esophageal carcinogenesis
118 auth.
J. Weaver,
C. Ross-Innes,
N. Shannon,
A. Lynch,
T. Forshew,
M. Barbera,
M. Murtaza,
C. Ong,
P. Lao-Sirieix,
M. Dunning,
Laura Smith,
Mike L. Smith,
Charlotte Anderson,
B. Carvalho,
M. O'Donovan,
...
T. Underwood,
A. May,
N. Grehan,
R. Hardwick,
J. Davies,
A. Oloumi,
S. Aparicio,
C. Caldas,
M. Eldridge,
P. Edwards,
N. Rosenfeld,
S. Tavaré,
R. Fitzgerald,
S. Hayes,
Ang Yeng,
A. Lydon,
Soney Dharmaprasad,
S. Greer,
S. Preston,
S. Oakes,
V. Save,
S. Paterson-brown,
O. Tucker,
D. Alderson,
P. Taniere,
J. Kelly,
James P. Byrne,
D. Sharland,
N. Holling,
Lisa J. Boulter,
F. Noble,
B. Stacey,
C. Crichton,
Hugh Barr,
N. Shepherd,
L. Almond,
O. Old,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
R. Mason,
F. Chang,
J. Zylstra,
Grant Sanders,
T. Wheatley,
R. Berrisford,
T. Bracey,
C. Harden,
David G. Bunting,
T. Roques,
J. Nobes,
Suat Loo,
M. Lewis,
E. Cheong,
O. Priest,
S. Parsons,
I. Soomro,
P. Kaye,
J. Saunders,
Vincent Pang,
N. Welch,
J. Catton,
J. Duffy,
K. Ragunath,
L. Lovat,
R. Haidry,
H. Miah,
S. Kerr,
V. Eneh,
R. Butawan,
L. Igali,
H. Ford,
D. Gilligan,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
Vijayendran Sudjendran,
A. Metz,
N. Carroll,
M. Scott,
A. Cluroe,
A. Miremadi,
B. Mahler-Araujo,
Olga Knight,
B. Nutzinger,
C. Peters,
Z. Abdullahi,
Irene Debriram-Beecham,
S. Malhotra,
J. Crawte,
S. Macrae,
A. Noorani,
R. Elliott,
Xiaodun Li,
Lawrence Bower,
A. Achilleos,
J. Bornschein,
S. Zeki,
Hamza Chettouh,
M. Secrier,
Nadeera de Silva,
Eleanor Gregson,
Tsun-Po Yang,
J. O'Neil
|
8 |
2014 |
8
🐜
|
|
🐜
|
A comprehensive assessment of somatic mutation detection in cancer using whole-genome sequencing
83 auth.
T. Alioto,
I. Buchhalter,
S. Derdak,
B. Hutter,
M. Eldridge,
E. Hovig,
Lawrence E Heisler,
Timothy A Beck,
J. Simpson,
L. Tonon,
A. Sertier,
A. Patch,
N. Jäger,
Philip Ginsbach,
Ruben M. Drews,
...
N. Paramasivam,
Rolf Kabbe,
S. Chotewutmontri,
N. Diessl,
C. Previti,
Sabine Schmidt,
B. Brors,
L. Feuerbach,
Michael C. Heinold,
Susanne N. Gröbner,
A. Korshunov,
P. Tarpey,
A. Butler,
Jonathan Hinton,
David Jones,
A. Menzies,
K. Raine,
Rebecca Shepherd,
L. Stebbings,
J. Teague,
Paolo Ribeca,
F. C. Giner,
S. Beltran,
E. Raineri,
Marc Dabad,
S. Heath,
M. Gut,
R. Denroche,
N. Harding,
Takafumi N. Yamaguchi,
Akihiro Fujimoto,
H. Nakagawa,
V. Quesada,
R. Valdés-Mas,
S. Nakken,
Daniel Vodák,
Lawrence Bower,
A. Lynch,
Charlotte Anderson,
N. Waddell,
J. Pearson,
S. Grimmond,
Myron Peto,
P. Spellman,
Minghui He,
C. Kandoth,
Semin Lee,
John Zhang,
Louis Letourneau,
Singer Ma,
S. Seth,
D. Torrents,
Liu Xi,
D. Wheeler,
C. López-Otín,
E. Campo,
P. Campbell,
P. Boutros,
X. Puente,
D. Gerhard,
S. Pfister,
J. McPherson,
T. Hudson,
M. Schlesner,
P. Lichter,
R. Eils,
David T. W. Jones,
I. Gut
|
8 |
2015 |
8
🐜
|
|
🐜
|
Whole-genome sequencing provides new insights into the clonal architecture of Barrett’s esophagus and esophageal adenocarcinoma
106 auth.
C. Ross-Innes,
J. Becq,
Andrew Warren,
R. K. Cheetham,
H. Northen,
M. O'Donovan,
S. Malhotra,
M. di Pietro,
S. Ivakhno,
M. He,
J. Weaver,
A. Lynch,
Z. Kingsbury,
M. Ross,
S. Humphray,
...
D. Bentley,
R. Fitzgerald,
S. Hayes,
Y. Ang,
I. Welch,
S. Preston,
S. Oakes,
V. Save,
R. Skipworth,
O. Tucker,
J. Davies,
C. Crichton,
Christian Schusterreiter,
T. Underwood,
F. Noble,
B. Stacey,
J. Kelly,
James P. Byrne,
Annette Haydon,
D. Sharland,
J. Owsley,
Hugh Barr,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
R. Mason,
F. Chang,
J. Zylstra,
Grant Sanders,
T. Wheatley,
R. Berrisford,
T. Bracey,
C. Harden,
David G. Bunting,
T. Roques,
J. Nobes,
Suat Loo,
M. Lewis,
E. Cheong,
O. Priest,
S. Parsons,
I. Soomro,
Philip Kaye,
J. Saunders,
Vincent Pang,
N. Welch,
J. Catton,
J. Duffy,
K. Ragunath,
L. Lovat,
R. Haidry,
H. Miah,
S. Kerr,
V. Eneh,
R. Butawan,
T. Roques,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
L. Igali,
Sharon P. Walton,
A. Dann,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
Vijayendran Sudjendran,
M. Scott,
A. Cluroe,
A. Miremadi,
B. Mahler-Araujo,
B. Nutzinger,
C. Peters,
Z. Abdullahi,
J. Crawte,
S. Macrae,
A. Noorani,
R. Elliott,
Lawrence Bower,
Paul A. Edwards,
S. Tavaré,
M. Eldridge,
Jan Bornschein,
M. Secrier,
Tsun-Po Yang,
J. R. O'Neill,
Kasia Adamczuk,
P. Lao-Sirieix,
N. Grehan,
Laura Smith,
S. Lishman,
D. Beardsmore,
Sarah N Dawson
|
8 |
2015 |
8
🐜
|
|
🐜
|
Organoid cultures recapitulate esophageal adenocarcinoma heterogeneity providing a model for clonality studies and precision therapeutics
23 auth.
Xiaodun Li,
Hayley E. Francies,
M. Secrier,
J. Perner,
A. Miremadi,
N. Galeano-Dalmau,
William J. Barendt,
L. Letchford,
G. Leyden,
Emma K. Goffin,
...
Andrew S. Barthorpe,
H. Lightfoot,
Elisabeth Chen,
James P. Gilbert,
A. Noorani,
G. Devonshire,
Lawrence Bower,
Amber Grantham,
S. Macrae,
N. Grehan,
D. Wedge,
R. Fitzgerald,
M. Garnett
|
7 |
2018 |
7
🐜
|
|
🐜
|
The landscape of selection in 551 esophageal adenocarcinomas defines genomic biomarkers for the clinic
95 auth.
A. Frankell,
S. Jammula,
Xiaodun Li,
G. Contino,
S. Killcoyne,
Sujath Abbas,
J. Perner,
Lawrence Bower,
G. Devonshire,
E. Ococks,
N. Grehan,
James Mok,
Maria O’Donovan,
S. Macrae,
M. Eldridge,
...
S. Tavaré,
R. Fitzgerald,
A. Noorani,
Paul A. Edwards,
B. Nutzinger,
C. Hughes,
E. Fidziukiewicz,
A. Northrop,
R. de la Rue,
A. Katz-Summercorn,
D. Loureda,
Maria O’Donovan,
A. Miremadi,
S. Malhotra,
M. Tripathi,
A. Lynch,
M. Eldridge,
M. Secrier,
G. Devonshire,
J. Davies,
C. Crichton,
N. Carroll,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
V. Sujendran,
S. Hayes,
Y. Ang,
A. Sharrocks,
S. Preston,
S. Oakes,
I. Bagwan,
V. Save,
R. Skipworth,
T. Hupp,
J. R. O'Neill,
O. Tucker,
Andrew Beggs,
P. Taniere,
S. Puig,
T. Underwood,
Rob Walker,
B. Grace,
Hugh Barr,
N. Shepherd,
O. Old,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
F. Chang,
J. Zylstra,
U. Mahadeva,
V. Goh,
F. Ciccarelli,
Grant Sanders,
R. Berrisford,
C. Harden,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
S. Parsons,
I. Soomro,
Philip Kaye,
J. Saunders,
L. Lovat,
R. Haidry,
L. Igali,
M. Scott,
S. Sothi,
S. Suortamo,
S. Lishman,
George B. Hanna,
Krishna Moorthy,
C. Peters,
A. Grabowska,
R. Turkington,
D. Mcmanus,
H. Coleman,
D. Khoo,
W. Fickling,
R. Fitzgerald
|
7 |
2018 |
7
🐜
|
|
🐜
|
Identification of Subtypes of Barrett's Esophagus and Esophageal Adenocarcinoma Based on DNA Methylation Profiles and Integration of Transcriptome and Genome Data.
94 auth.
S. Jammula,
A. Katz-Summercorn,
Xiaodun Li,
C. Linossi,
E. Smyth,
Sarah Killcoyne,
D. Biasci,
Vinod V. Subash,
Sujath Abbas,
A. Blasko,
G. Devonshire,
Amber Grantham,
Filip Wronowski,
M. O'Donovan,
N. Grehan,
...
M. Eldridge,
S. Tavaré,
Rebecca C. Fitzgerald,
A. Noorani,
P. Edwards,
B. Nutzinger,
C. Hughes,
E. Fidziukiewicz,
Jan Bornschein,
S. Macrae,
J. Crawte,
A. Northrop,
G. Contino,
R. de la Rue,
A. Miremadi,
S. Malhotra,
M. Tripathi,
A. Lynch,
M. Eldridge,
M. Secrier,
Lawrence Bower,
G. Devonshire,
J. Perner,
S. Jammula,
J. Davies,
C. Crichton,
N. Carroll,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
V. Sujendran,
S. Hayes,
Y. Ang,
S. Preston,
S. Oakes,
I. Bagwan,
V. Save,
R. Skipworth,
Ted R. Hupp,
J. R. O'Neill,
O. Tucker,
A. Beggs,
P. Taniere,
S. Puig,
T. Underwood,
F. Noble,
J. Owsley,
Hugh Barr,
N. Shepherd,
O. Old,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
F. Chang,
J. Zylstra,
U. Mahadeva,
V. Goh,
Francesca D. Ciccarelli,
Grant Sanders,
R. Berrisford,
C. Harden,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
Simon L. Parsons,
I. Soomro,
Philip Kaye,
J. Saunders,
L. Lovat,
R. Haidry,
L. Igali,
M. Scott,
S. Sothi,
S. Suortamo,
S. Lishman,
George B. Hanna,
Krishna Moorthy,
Christopher J. Peters,
A. Grabowska,
R. Turkington
|
6 |
2020 |
6
🐜
|
|
🐜
|
Genomic evidence supports a clonal diaspora model for metastases of esophageal adenocarcinoma
26 auth.
A. Noorani,
Xiaodun Li,
M. Goddard,
J. Crawte,
L. Alexandrov,
M. Secrier,
M. Eldridge,
Lawrence Bower,
J. Weaver,
P. Lao-Sirieix,
I. Martincorena,
I. Debiram-Beecham,
N. Grehan,
S. Macrae,
S. Malhotra,
...
A. Miremadi,
Tabitha Thomas,
S. Galbraith,
Lorraine Petersen,
S. D. Preston,
D. Gilligan,
A. Hindmarsh,
R. Hardwick,
M. Stratton,
D. Wedge,
R. Fitzgerald
|
6 |
2018 |
6
🐜
|
|
🐜
|
Identification of Prognostic Phenotypes of Esophageal Adenocarcinoma in 2 Independent Cohorts.
93 auth.
Tarek Sawas,
S. Killcoyne,
P. Iyer,
Kenneth K Wang,
T. Smyrk,
J. Kisiel,
Yi Qin,
D. Ahlquist,
A. Rustgi,
Rui J. Costa,
M. Gerstung,
R. Fitzgerald,
D. Katzka,
A. Noorani,
P. Edwards,
...
N. Grehan,
B. Nutzinger,
C. Hughes,
E. Fidziukiewicz,
J. Bornschein,
S. Macrae,
J. Crawte,
G. Contino,
Xiaodun Li,
Rachel Rue,
M. O'Donovan,
Ahmad Miremad,
S. Malhotra,
M. Tripathi,
S. Tavaré,
A. Lynch,
M. Eldridge,
M. Secrier,
Lawrence Bower,
G. Devonshire,
J. Perner,
S. Jammula,
J. Davies,
C. Crichton,
N. Carroll,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
V. Sujendran,
S. Hayes,
Y. Ang,
S. Preston,
S. Oakes,
I. Bagwan,
V. Save,
R. Skipworth,
T. Hupp,
J. R. O'Neill,
O. Tucker,
A. Beggs,
P. Tanière,
S. Puig,
T. Underwood,
F. Noble,
J. Owsley,
H. Barr,
N. Shepherd,
O. Old,
J. Lagergren,
J. Gossage,
A. Davies,
F. Chang,
J. Zylstra,
U. Mahadeva,
V. Goh,
F. Ciccarelli,
Grant Sanders,
R. Berrisford,
C. Harden,
D. Bunting,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
S. Parsons,
I. Soomro,
P. Kaye,
J. Saunders,
L. Lovat,
R. Haidry,
V. Eneh,
L. Igali,
M. Scott,
S. Sothi,
S. Suortamo,
S. Lishman,
G. Hanna,
C. Peters,
A. Grabowska,
R. Turkington
|
5 |
2018 |
5
🐜
|
|
🐜
|
Patient-specific cancer genes contribute to recurrently perturbed pathways and establish therapeutic vulnerabilities in esophageal adenocarcinoma
98 auth.
T. Mourikis,
Lorena Benedetti,
Elizabeth Foxall,
D. Temelkovski,
Joel Nulsen,
J. Perner,
Matteo Cereda,
J. Lagergren,
M. Howell,
C. Yau,
R. Fitzgerald,
Paola Scaffidi,
A. Noorani,
Paul A. Edwards,
R. Elliott,
...
N. Grehan,
B. Nutzinger,
C. Hughes,
E. Fidziukiewicz,
Jan Bornschein,
S. Macrae,
J. Crawte,
A. Northrop,
G. Contino,
Xiaodun Li,
R. de la Rue,
A. Katz-Summercorn,
Sujath Abbas,
D. Loureda,
M. O'Donovan,
A. Miremadi,
S. Malhotra,
M. Tripathi,
S. Tavaré,
A. Lynch,
M. Eldridge,
M. Secrier,
Lawrence Bower,
G. Devonshire,
S. Jammula,
J. Davies,
C. Crichton,
N. Carroll,
P. Safranek,
A. Hindmarsh,
V. Sujendran,
S. Hayes,
Y. Ang,
A. Sharrocks,
S. Preston,
S. Oakes,
I. Bagwan,
V. Save,
R. Skipworth,
T. Hupp,
J. Robert O’Neill,
O. Tucker,
Andrew Beggs,
P. Taniere,
S. Puig,
T. Underwood,
Rob Walker,
B. Grace,
Hugh Barr,
N. Shepherd,
O. Old,
J. Gossage,
A. Davies,
F. Chang,
J. Zylstra,
U. Mahadeva,
V. Goh,
Grant Sanders,
R. Berrisford,
C. Harden,
M. Lewis,
E. Cheong,
B. Kumar,
S. Parsons,
I. Soomro,
Philip Kaye,
J. Saunders,
L. Lovat,
R. Haidry,
L. Igali,
M. Scott,
S. Sothi,
S. Suortamo,
S. Lishman,
George B. Hanna,
C. Peters,
Krishna Moorthy,
A. Grabowska,
R. Turkington,
D. Mcmanus,
D. Khoo,
W. Fickling,
F. Ciccarelli
|
4 |
2019 |
4
🐜
|
